ECショップ運営を効率化！会計ソフト「freee」「マネーフォワードクラウド」「弥生」

2026年2月8日2026年3月8日

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会計ソフトと言えば、頭に浮かぶのは「freee 会計」「マネーフォワード」「弥生シリーズ」ではないでしょうか。
ネットショップをこれから開設する方、運営中の方におすすめなのは、やはりこの3大会計ソフト。

このページでは、クラウド会計ソフトとECカートの連携について解説します。
バックオフィスの効率化にお役立てください。

クラウド会計ソフトで効率化

「freee 会計」「マネーフォワードクラウド」「弥生シリーズ」などのクラウド会計ソフトは、個人（フリーランス・個人事業主）、法人のどちらにも対応したサービスが展開されています。

個人・法人に関わらず、クラウド会計ソフトを利用することによって業務効率化ができ、ネットショップ本来の業務に専念する時間を作れることが期待できます。

クラウド会計ソフトは、インターネットを使える環境であればどこでも利用できて、銀行口座、クレジットカードとの連携によるデータ取得などが得意です。
レシートをスマホで撮影するだけでデータ取得ができる便利機能も。

個人事業主の方は確定申告書の作成まで一貫してできるので大変便利です。

無料お試しや資料請求などのサービスがありますので、どの会計ソフトが使いやすいかを試してみることをおすすめします。

ECカート・POSレジと連携

クラウド会計ソフトは、ECカートやPOSレジとの自動連携も可能。
ただし、全てのECカート、POSレジと連携できるということではありません。
会計ソフトによって、自動連携可能なECカート、POSレジがあります。

ECカートとの連携の注意点

先述のとおり、ECカートと連携する場合、会計ソフトによって自動連携できるものとできないものがあります。

また、自動連携の費用が無料の場合と有料の場合がありますので、確認が必要です。
つまり、会計ソフトの利用料金だけでOKな場合と、「会計ソフトの利用料金+ECカートASPに支払う自動連携費用」が必要となる場合があります。

また、複数のネットショップを運営している場合、一つは自動連携できるが、もう一つはできないということもあるかもしれません。
一つだけでも自動連携しておくと手間が省けるかもしれませんし、一つだけ連携しておいてかえって煩雑になるということもあるかもしれません。
トータルでどうしたいのかを考えておく必要はありそうです。

会計ソフトとネットショップのECカートは、「必ず自動連携しなければならない」「自動連携＝メリット」というわけではありませんが、会計ソフトとの相性を調べておいて、ECカートASPを選ぶ判断材料にすることもできます。

ECカートとの連携方法は自動連携だけではない

クラウド会計ソフトとECカートの連携方法は、自動連携だけではありません。
「自動連携ができない＝相性が悪い」ということではないので、クラウド会計ソフトとECカートが自動連携できなくても諦めないでください。

次に、自動連携以外の方法を2つ解説します。

① 会計ソフトに手入力

ネットショップの売上データを手作業でポチポチと会計ソフトに入力することはもちろん可能です。
この方法ならどのECカートを使っていても問題ないでしょう。

デメリットは、入力に時間がかかり、数字の打ち間違いなどが起きる可能性があることです。

「自動連携」と「手入力」の中間の方法がありますので、次にご紹介します。

② ECカートのデータをダウンロードして会計ソフトに取り込む

ECカートASPの売上データをダウンロードして、クラウド会計ソフトに取り込む（インポートする）方法があります。

【手順】カラーミーショップを例に解説

Step. 1　カラーミーショップの管理画面の「データダウンロード」から注文データをダウンロードします。
　　　　　（データはCSV形式になっています。）
Step. 2　取得したデータを会計ソフトにインポートします。

※ 会計ソフトによって、取得したデータをそのまま取り込める場合と、データの項目を並べ変えたりする必要がある場合があります。

カラーミーショップからの書き出し形式

2026年2月現在

会計ソフト	専用形式の有無	作業
弥生会計	あり（弥生会計形式）	ダウンロードしてそのまま取込可能
マネーフォワード	あり（MF形式）	ダウンロードしてそのまま取込可能
freee会計	なし（カラーミー標準形式）	Excel等で並べ替えや加工が必要

freee会計の形式でのダウンロードはできないため、そのままインポートすることはできません。
freee会計の公式ヘルプやテンプレートを参照し、必要な項目（取引日、金額など）を整えてください。

他のECカートASPも流れは同じ

CSVデータをダウンロードして会計ソフトにインポートするという流れは、どのECカートもほとんど同じです。
ダウンロードしたデータをそのまま取込可能かどうかは、ECカートと会計ソフトの組み合わせによります。

慣れるまで少し難しく感じるかもしれませんが、データを一括で取り込むことができるので、手入力より時間がかからず、入力のミスを回避できます。

カラーミーショップは freee会計と自動連携も可能

カラーミーショップは「かんたんfreee会計データ連携」というアプリが提供されており、freee会計と自動連携も可能です。
ただし、アプリ利用料金が発生します。

コストを抑えたい場合は、「かんたんfreee会計データ連携」アプリを利用せずに、先程解説した手動での連携が可能です。

連携一覧表

ECカートと会計ソフトの組み合わせを表にまとめてみました。
※2026年2月現在の状況です。ご契約の際は、それぞれの公式の最新情報をご確認ください。

カートASP	freee会計	マネーフォワード	弥生会計
カラーミーショップ	連携（有料アプリ）※1	CSV取込	CSV取込
makeshop	CSV取込 ※2	CSV取込 ※2	CSV取込 ※2
STORES	直接連携	直接連携	直接連携
BASE	直接連携	直接連携 ※3	CSV取込 ※4
おちゃのこねっと	CSV取込 ※5	CSV取込 ※5	CSV取込 ※5
Shopify	連携（有料アプリ）	CSV取込 ※6	CSV取込 ※6

※1 CSV取込も可能。ただし、freee会計のインポート用フォーマットに合わせて、カラーミーショップのCSVデータを編集する必要あり。
※2 makeshop については詳細が不明。「freee会計」「弥生」「マネーフォワード」などの会計ソフトと、CSVファイルによる手動でのデータ連携が可能ということは確認できています。CSVデータを編集する必要の有無については不明です。
※3 マネーフォワードクラウド確定申告（個人用）のみ。
※4 弥生会計のインポート用フォーマットに合わせて、BASEのCSVデータを編集する必要あり。
※5 おちゃのこねっとについては詳細不明ですが、ダウンロードする前に、ダウンロードするCSV項目を選択したり、CSV項目の並び順を変更することができるようです。
※6 CSV取込はアプリ（無料プラン）で可能だが、ShopifyのCSVデータを編集する必要あり。アプリ（有料プラン）では、インポート用フォーマットに合わせたCSVデータの取得可能。